pacsifier.cli package

Submodules

• pacsifier.cli.add_karnak_tags module
  • get_parser()
  • main()
  • tag_all_dicoms_within_root_folder()
  • tag_dicom_file()
• pacsifier.cli.anonymize_dicoms module
  • anonymize_all_dicoms_within_root_folder()
  • anonymize_dicom_file()
  • fuzz_date()
  • get_parser()
  • main()
  • parse_date()
  • shift_date_by_some_days()
• pacsifier.cli.create_dicomdir module
  • add_or_retrieve_name()
  • create_dicomdir()
  • generate_new_folder_name()
  • get_parser()
  • main()
  • move_and_rename_files()
• pacsifier.cli.docker_wrappers module
  • docker_add_karnak_tags()
  • docker_anonymize_dicoms()
  • docker_create_dicomdir()
  • docker_extract_carestream_report()
  • docker_get_pseudonyms()
  • docker_move_dumps()
  • docker_pacsifier()
  • get_docker_image_name()
  • run_docker_command()
• pacsifier.cli.extract_carestream_report module
  • extract_txt_report()
  • get_parser()
  • main()
  • replace_special_char_combinations()
• pacsifier.cli.get_pseudonyms module
  • check_config_file_deid()
  • check_queryfile_content()
  • convert_csv_to_deid_json()
  • generate_csv_with_pseudonyms_and_day_shifts()
  • get_deid_day_shifts()
  • get_deid_pseudonyms()
  • get_parser()
  • main()
  • split_deid_query_json_in_batch()
• pacsifier.cli.move_dumps module
  • get_parser()
  • main()
  • move()
• pacsifier.cli.pacsifier module
  • check_query_table_allowed_filters()
  • get_parser()
  • main()
  • parse_findscu_dump_file()
  • parse_query_table()
  • process_person_names()
  • readLineByLine()
  • retrieve_dicoms_using_table()
  • upload_dicoms()

Module contents